府衙的会议散场了，袁崇焕暂且将郑芝龙和冯澄世收押，他立刻写好了报捷文书，让塘马八百里加急飞送京师，然后他自己去府衙边的监狱中和郑芝龙交流去了。
刘毅将所有战死的兄弟们的军牌全部收集好，天气炎热，兄弟们的尸首是带不回去了，这么多尸体如果不处理又会产生瘟疫，刘毅只得忍痛将弟兄们的尸体火化，将骨灰装在一个个白色的瓷坛当中，上面挂上军牌，带回太平府。他答应过将士们还有太平府的父老乡亲们，一定要带他们回家。
此战刘毅的青弋军出战六百人，足足阵亡了五十一名骑兵和一百零二名步兵，受伤的约有七八十人，其中重伤的有大约五十人，这些士兵回去之后大部分都必须退役了，很多人成了残疾，刘毅已经想好了，退役和战死的士兵每人补偿纹银二百两，将他们的牌位请入芜湖县城的太平府显忠祠供奉，每日香火祭奠。
七月的这场东南大战，以袁崇焕为首的五省会剿军和郑芝龙的海盗大军在福建进行了十几天的厮杀，最终以官军获胜，歼灭郑芝龙全部陆军并且生俘郑芝龙结束，捷报经过八百里加急，从厦门直发京师，换马不换人，仅用了两天半的时间就传进了京师，由兵部尚书张鹤鸣亲自向皇上和诸位大臣做了汇报。
天启皇帝闻言大喜，下令犒赏三军，并按照袁崇焕的提议招降郑芝龙，授予郑芝龙福建海防游击将军，官至从四品。并由接任朱钦相的新任福建巡抚熊文灿负责安排郑芝龙的一切大小事务。同时命令袁崇焕率领捷报中提到的有大功之臣立刻进京，天启要亲自接见这些有功官将，毕竟这是天启七年极大的一场胜利，可以和袁崇焕年初的宁锦大捷相媲美。而且两场战役都是袁崇焕指挥打的，还都大胜。就是一向和袁崇焕不和的阉党众人，包括魏忠贤自己这次也不说话了，本想借着一月平贼的圣旨让袁崇焕倒大霉，没想到竟然他娘的搬起石头砸自己的脚，袁崇焕二十天就把活干完了。阉党众人是哑巴吃黄连有苦说不出，现在袁崇焕的威望达到了顶峰，连天启帝也不住的对魏忠贤说袁崇焕是国之栋梁。
圣旨很快又以八百里加急的方式传递了回去，天启七年七月二十六，圣旨达到福州府，袁崇焕留下朱钦相接防厦门，自己已经率军返回福州府。圣旨到后众人沐浴焚香接旨，特别是听到皇上不计前嫌封郑芝龙为福建海防游击，提领福建水师，协防闽浙南直隶三地的命令之后。郑芝龙大哭拜伏在地，口称死罪。
而袁崇焕更是要率领五省有功军将即刻启程前往京师面圣，随行人员包括侯峰，杜弘域，陈严龄，邹秉军等等，袁崇焕特地要将刘毅带上，因为袁崇焕的战报里面特地提到了刘毅，将刘毅的功劳原原本本的说给了圣上和朝中诸位大臣听。
刘毅对袁崇焕报告，能否允许他先将战死的士兵们的骨灰运回太平府，并且亲自祭奠他们，然后他会快马走应天府官道，追上袁崇焕，反正袁崇焕不是用八百里加急的速度，一行人走走停停，怎么也得用八九天才能赶到京师。刘毅先快马将士兵们的骨灰送回去，祭奠仪式一结束，刘毅就去追赶袁崇焕，绝不耽误进京。